Компьютерные технологии — новые возможности в лечении рака

При возросшем количестве исследований геномных изменений и возможных способов лечения остро стоит проблема анализа существенных объемов данных и разработки на их основе рекомендаций по лечению. Безусловно, это неприемлемо в случае смертельных видов рака. Например, при такой разновидности рака мозга как глиобластома, когда средняя продолжительность жизни обычно не превышает 15 месяцев со дня постановки диагноза.

На помощь приходят новые технологии. Так, недавно успешную проверку прошла когнитивная система Watson от IBM: в ходе тестирования она обработала информацию более 20 массивов из известной базы данных медико-биологических публикаций PubMed.

В совместном исследовании Нью-Йоркского центра геномики и Университета Рокфеллера новая технология сравнивалась с используемым сегодня методом анализа геномной информации злокачественных опухолей, который охватывает лишь ограниченную группу генов. Бета-версии Watson for Genomics была поставлена задача анализа данных, полученных при полном секвенировании (определении аминокислотной или нуклеотидной последовательности) генома глиобластомы. Онкологи и биоинформатики проанализировали последовательность ДНК и РНК злокачественных опухолей и ДНК из крови больного.

Результаты сопоставления разных способов анализа генома впечатляют. Во-первых, система Watson идентифицировала геномные изменения и подобрала лечение за 10 минут, в то время как у группы врачей ушло на это 160 часов. Во-вторых, система распознала больше мутаций.

Система Watson for Genomics уже работает в США, Бразилии, Китае и Европе.

2905 просмотров